维尔茨堡大学是德国一流综合大学U15大学联盟的成员,同时也是有欧洲常青藤联盟的科英布拉集团(Coimbra Group)的盟校之一。与全世界几百所大学,比如中国的北京大学、中国人民大学、南京大学,英国的剑桥大学(语言学专业)、华威大学、约克大学,美国的德克萨斯大学奥斯汀分校等建立了合作伙伴关系并开展校际(科系)交换和科研合作。如今经过几个世纪的发展,维尔茨堡大学除原先的医学、神学、哲学和法律等四大经典学科外,还增加了各类现代学科,比如纳米结构技术、功能材料技术、生物医学、当代中国研究、空间战略,为学生提供广泛的学术课程。